“血水圣灵”总部有东方和西方两个，在教主左坤之下。东方总部设在台北市，负责台湾和大陆在内的亚洲国家和地区的活动；西方总部设在美国洛杉矶市，负责亚洲以外国家和地区的活动。“血水圣灵”邪教组织始终把向境内传播作为其发展重点，通过派遣骨干以探亲、旅游、投资等名义入境传“教”，秘密发展成员，建立地下组织，其总部利用互联网不断发布左坤的“指令”，加强对成员的精神控制。该组织在境内建立了一大批基层“教会”和聚会点，活动涉及大部分省(区、市)，裹胁了大量不明真相的群众。左坤自称是“神的使徒”，对所有“教会”发号施令。 “教会”下设“带领同工”、“同工”、“长老”、“执事”等职务，形成了“使徒” (左坤)、“总带领同工”、“带领同工”、“长老”、“执事”的5 级职务体系。在境内划分了若干大区，直接归左坤及其总部操纵指挥，形成了总部、大区、省片部、片区、教会、聚会点的6级组织架构。各大区内设福音队、后勤生意组、青少年造就组、文字组、文艺组等机构，专门从事“传教”、经营经济实体、培训青年骨干、对外联络等活动。组织内男性称为“使者”，女性称为“使女”，互成兄弟、姊妹或B(男)、S(女)；组织严密，实行一级管一级、单线联系制度，联络时以代号相称；活动场所悬挂绘有地球、奔马、老鹰等图案组成的“真理大旗”，成员穿印有狮子、牛、人、鹰等四活物图案的服装。